TinyMCE erzeugt absoluten Müll. FCK erzeugt weniger Müll, kann aber auch mit dem eingebauten Browser-Stil in Konflikt geraten (standardmäßig FCK-Stile mit Tags anstelle von Stilattributen, z. B. <stark> statt < span style = "font-weight: bold;" >, jedoch schlagen cmd-b in Safari erzeugt das letztere, und FCK wird sich dessen nicht bewusst sein, wodurch es Ihnen ermöglicht wird, Stile ohne Effekt zu verschachteln und Ihnen nicht zu erlauben, die FCK-Funktionalität zu nutzen, um die eingebaute Funktionalität umzukehren.
Beide produzieren Müll im IE, aber das ist, weil IE DOM verrückt ist.
Zum Beispiel: http://annevankesteren.nl/2005/07/contenteditable