tcsh Fehler: While-Schleife

Question

Dies ist ein grundlegendes Programm, aber da ich ein Neuling bin, bin ich nicht in der Lage, die Lösung herauszufinden.

Ich habe eine Datei rama.xvg in dem folgenden Format benannt:

-75.635 105.879 ASN-2 
-153.704 64.7089 ARG-3 
-148.238 -47.6076 GLN-4 
-63.2568 -8.05441 LEU-5 
-97.8149 -7.34302 GLU-6 
-119.276 8.99017 ARG-7 
-144.198 -103.917 SER-8 
-65.4354 -10.3962 GLY-9 
-60.6926 12.424 ARG-10 
-159.797 -0.551989 PHE-11 
65.9924 -48.8993 GLY-12 
179.677 -7.93138 GLY-13 
.......... 
........... 
-70.5046 38.0408 GLY-146 
-155.876 153.746 TRP-147 
-132.355 151.023 GLY-148 
-66.2679 167.798 ASN-2 
-151.342 -33.0647 ARG-3 
-146.483 41.3483 GLN-4 
.......... 
.......... 
-108.566 0.0212432 SER-139 
47.6854 33.6991 MET-140 
47.9466 40.1073 ASP-141 
46.4783 48.5301 SER-142 
-139.17 172.486 LYS-143 
    58.9514 32.0602 SER-144 
    60.744 18.3059 SER-145 
-94.0533 165.745 GLY-146 
-161.809 177.435 TRP-147 
129.172 -101.736 GLY-148 

Ich brauche alle Linien zu extrahieren „ASN-2“ in einer Datei all_1.dat enthält, und so weiter für alle 147 Rückstände.

Wenn ich den folgenden Befehl im Terminal laufen, ist es die gewünschte Ausgabe für ASN-2 gibt:

awk '{if(NR%147 == 1) printf $0 "\n"}' rama.xvg > all_1.dat 

zu tun es immer wieder für alle Rückstände zu vermeiden, habe ich den folgenden Code geschrieben.

#!/bin/tcsh 
set i = 1 
    while ($i < 148) 
    echo $i 
    awk '{if(NR%147 == i) printf $0 "\n"}' rama.xvg > all_"$i".dat 
    @ i++ 

end 

Aber dieser Code druckt die Zeilen mit GLY-148 in allen Ausgabedateien.

Bitte lassen Sie mich wissen, was ist der Fehler in diesem Code. Ich denke, es hängt mit dem Nisten zusammen.

Answer 1

In Ihrer awk -line ist die Variable i eine awk-Variable, keine Shellvariable! Wenn Sie verwenden möchten Shell-Variable $i können Sie tun:

awk -v i="$i" '{if(NR%147 == i) printf $0 "\n"}' rama.xvg > all_"$i".dat 

Aber ich denke, besser wäre Ihr while -loop in awk setzen:

awk '{for (i=1; i<=147; i++) { if (NR%147==i) {printf $0 "\n" > ("all_" i ".dat") } } }' rama.xvg