Tiff-Median-Filter exportiert als Einzelbild OpenCV Python

Question

Ich versuche ein Programm über eine Sequenz von 60 Frames (in einer TIFF-Datei) laufen zu lassen und einen Rauschreduzierungsfilter (Median) anzuwenden, um die Frames aufzuräumen Bit vor der Analyse. Jedoch gibt mein Programm (das es Bild für Bild aufnimmt) ein Einzelbild-TIFF aus; Warum das? Wie könnte ich mich darum kümmern?

from PIL import Image 
import cv2 
import numpy as np 

im = Image.open('example_recording.tif').convert('L') 
im.save('greyscale_example.tif') #converts to greyscale 

width,height = im.size 
image_lookup = 0 

class ImageSequence: 
    def __init__(self, im): 
     self.im = im 
    def __getitem__(self, ix): 
     try: 
      if ix: 
       self.im.seek(ix) 
      return self.im 
     except EOFError: 
     raise IndexError # if end of sequence 

for frame in ImageSequence(im): 
     imarray = np.array(frame) 
     Blur = cv2.medianBlur(imarray,5) 
     frame = Image.fromarray(Blur) 

im.save('corrected.tif') 

Answer 1

Ich glaube, Sie werden Ihre endgültigen Stapel nicht korrekt wieder Komponieren (nicht oben gezeigt?) Und einen einzelnen Frame (die letzte Frame) zu speichern?

Eine Alternative ist OpenCV und Verwendung scipy zu verzichten:

import numpy 
import scipy 
from scipy import ndimage 

a = numpy.random.randint(0,255,(100,100,60)) 
a.shape 
#(100L, 100L, 60L) 

b = scipy.ndimage.filters.generic_filter(a, numpy.median, 5) 
b.shape 
#(100L, 100L, 60L)