logarithmisch y-Achse Bins in Python

Question

Ich versuche, ein Histogramm einer Datenspalte zu erstellen und plotten logarithmisch (y-axis) und ich bin nicht sicher, warum der folgende Code nicht funktioniert:

import numpy as np 
import matplotlib.pyplot as plt 
data = np.loadtxt('foo.bar') 
fig = plt.figure() 
ax = fig.add_subplot(111) 
plt.hist(data, bins=(23.0, 23.5,24.0,24.5,25.0,25.5,26.0,26.5,27.0,27.5,28.0)) 
ax.set_xlim(23.5, 28) 
ax.set_ylim(0, 30) 
ax.grid(True) 
plt.yscale('log') 
plt.show() 

Ich habe auch versucht, anstelle von plt.yscale('log')Log=true in der plt.hist Zeile und auch versucht habe ich ax.set_yscale('log'), aber nichts scheint zu funktionieren. Ich bekomme entweder ein leeres Plot, entweder ist die y-axis tatsächlich logarithmisch (mit dem Code wie oben gezeigt), aber es sind keine Daten geplottet (keine Bins).

Answer 1

versuchen

plt.yscale('log', nonposy='clip') 

http://matplotlib.org/api/pyplot_api.html#matplotlib.pyplot.yscale

Das Problem mit dem Boden des Balkens ist bei y ist = 0 und der Standard ist in gültigen Punkten zu maskieren (log(0) -> nicht definiert), wenn das zu tun Log-Transformation (es gab Diskussionen darüber, dies zu ändern, aber ich erinnere mich nicht daran, wie es gelaufen ist), also wenn es versucht, die Rechtecke für Ihr Balkendiagramm zu zeichnen, wird die untere Kante ausgeblendet -> keine Rechtecke.

Answer 2

np.logspace kehrt Bins in [1-10], logarithmisch Abstand - in meinem Fall xx ist ein npvector> 0, so dass die folgenden Code funktioniert der Trick

logbins=np.max(xx)*(np.logspace(0, 1, num=1000) - 1)/9 
hh,ee=np.histogram(xx, density=True, bins=logbins)