Einstellung des FreeSurfer-Subjektverzeichnisses durch Matlab

Question

Versuch, FreeSurfer durch Matlab zu unterhalten und das Subjektverzeichnis für Ausgabedateien festzulegen.

Irgendwelche Ideen, warum ...

curSub = 'subject_path' 

system(['export SUBJECTS_DIR=' curSub]) 

... wird nicht funktionieren?

Wenn ich FreeSurfer-Prozesse ausführen, versucht es, den Betreff-Ordner im Verzeichnis local/freesurfer/subjects zu erstellen.

Answer 1

Da 'system' den Export-Befehl in einer System-Shell ausführt, die nicht die Shell ist, aus der Sie MATLAB gestartet haben, und die neue Definition von SUBJECTS_DIR nur in der Tochter-Shell sichtbar ist, die dann wahrscheinlich unbekannt ist . https://de.mathworks.com/help/matlab/ref/system.html

Sie stattdessen setenv verwenden sollten ('SUBJECTS_DIR', curSub) https://de.mathworks.com/help/matlab/ref/setenv.html