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Ich möchte hsphase-Paket kompilieren (R-Paket in CRAN verfügbar).Kompilierungsfehler von R-Paket
Ich habe diesen Befehl in R install.packages("hsphase") verwendet.
Ich habe die folgenden Fehler bekommen:
g++ -m64 -shared -L/usr/lib64/R/lib -Wl,-z,relro -specs=/usr/lib/rpm/redhat/redhat-hardened-ld -o hsphase.so FastDist.o MAF.o Ohd.o TypeConversion.o block.o block4Phase.o co.o diag.o hsp.o main.o memory.o oh.o swDetect.o [1] 0 -L/usr/lib64/R/lib -lRlapack -L/usr/lib64/R/lib -lRblas -lgfortran -lm -lquadmath -fopenmp -L/usr/lib64/R/lib -lR
g++: error: [1]: No such file or directory
g++: error: 0: No such file or directory
/usr/share/R/make/shlib.mk:6: recipe for target 'hsphase.so' failed
make: *** [hsphase.so] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘hsphase’
* removing ‘/home/mhf/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.3/hsphase’
The downloaded source packages are in
‘/tmp/RtmpYukJQa/downloaded_packages’
Warning message:
In install.packages("hsphase") :
installation of package ‘hsphase’ had non-zero exit status
Ich bin mit Filzhut 24.
Die g ++ Version: gcc Version 6.1.1 20.160.621 (Red Hat 6.1.1-3) (GCC
)Bitte überprüfen Sie den Link Flagge: , was das ist: [1] 0
Das g ++ ist da. Es gibt einen Verknüpfungsfehler. – user1436187
Ich hatte ein ähnliches Problem bei der Installation eines anderen R-Pakets, und später festgestellt, dass einige der Abhängigkeiten für das erforderliche Paket fehlten, versuchen 'install.packages (" hphase ", Abhängigkeiten = TRUE)' –
Sie scheinen ein System zu fehlen- Ebenenabhängigkeit; Zeilen wie diese - '-specs =/usr/lib/rpm/redhat/redhat-hardened-ld' - sind ein guter Anhaltspunkt. Siehe [diese Frage] (http://stackoverflow.com/questions/34624428/g-error-usr-lib-rpm-redhat-redhat-hardened-cc1-no-that-file-and-directory). Diese – nrussell