Ich benutze ggplot2, um ein Forest Plot auf einem Mac mit Elcapitan zu erstellen. Es gibt schwache vertikale Linien im Hintergrund - dies sind keine Gitterlinien. Dies ist die „Thema“ Einstellung:Artefakt graue Linien im Hintergrund des Plots ggplot2 grid.arrange R Mac OSx Quarz
theme_set(theme_bw())
theme_update(
axis.line = element_line(colour = "black"),
axis.line.y=element_line(colour="white"),
panel.grid.major = element_blank(),
panel.grid.minor = element_blank(),
panel.border = element_blank(),
panel.background = element_blank(),
axis.text.y = element_blank(),
axis.ticks.y = element_blank(),
plot.margin = unit(c(0,0,0,0), "lines")
)
Alle Ideen, wie diese grauen Linien loszuwerden? Bin ein Anfänger bei der Verwendung dieser Platine und R und ggplot2-- Glücklich, Beispieldaten und meinen Code zu laden - aber nicht sicher, ob hier nützlich.
Screenshot der Parzelle:
UPDATE als Antwort auf Diegos Frage für den Code:
Dieser Code wurde basierend auf Code von Matt Statistik und Sachen - https://mcfromnz.wordpress.com/2012/11/06/forest-plots-in-r-ggplot-with-side-table/ - aber ich kann den Link zu seinem ursprünglichen Code nicht finden.
theme_set(theme_bw())
theme_update(
axis.line = element_line(colour = "black"),
axis.line.y=element_line(colour="white"),
panel.grid.major = element_blank(),
panel.grid.minor = element_blank(),
panel.border = element_blank(),
panel.background = element_blank(),
axis.text.y = element_blank(),
axis.ticks.y = element_blank(),
plot.margin = unit(c(0,0,0,0), "lines")
)
pD<- ggplot(datD,aes(cen,rev(author2))) +
geom_point(aes(fill = summary), size=1.7,shape=23,colour="black") +
geom_errorbarh(
aes(xmax = datD$high, xmin = datD$low, colour=summary),
height = 0.3, size=0.25) +
scale_x_continuous(
breaks = seq(0,1,.1), labels = seq(0,100,10)) +
labs(x="Risk, %", y="") +
theme(axis.text.x=element_text(size=2))+geom_text(aes(0, author2), label=(paste(rev(datD$author2),rev(datD$risk))), hjust=0, size=ifelse(rev(datD$author2)=="Heterogeneity (95% CI)",2,0), fontface="bold")
p2D<-pD+
theme(legend.position = "none",
axis.text.x = element_text(size=6),
axis.title = element_text(size=6,face="italic")) +
guides(size = FALSE) +
geom_hline(aes(yintercept=c((length(datD$authorREF2)-0.5))))
#Left hand side will be author_yr, Events, Participants
#V0 indicates how many y-axis datapoints there willbe
#V05 spaces out the table columns on the x-axis
#V1 is a vector of all the columns that will be in the table
lab_left1D<-data.frame(
V0 = factor(
c(as.factor(1:length(datD$authorREF2))),
levels=c(as.factor(length(datD$authorREF2):1))
),
V05 = rep(
c(1,1.25,1.5,1.7),
each=length(datD$authorREF2)
),
V1 = c(c(as.character(datD$authorREF2)),
c(as.character(datD$Events)),
c(as.character(datD$patients)),
c(as.character(datD$risk))))
data_table_left1D<-ggplot(lab_left1D,
aes(x = V05, y = V0,
label = format(V1, nsmall = 1))) +
geom_text(
aes(fontface =
ifelse(
V0==as.character((length(datD$authorREF2)-1)),'bold.italic',
ifelse(V0=='1','bold',
ifelse(V0==as.character
(length(datD$authorREF2)),'italic','plain')))),
size = ifelse(
lab_left1D$V0==as.character(length(datD$authorREF2)),0,2), hjust=0, vjust=1.3) + theme_bw() +
theme(panel.grid.major = element_blank(),
legend.position = "none",
panel.border = element_blank(),
#axis.line = element_line(colour = "black"),
axis.text.x = element_text(colour="white"),#element_blank(),
axis.text.y = element_blank(),
axis.ticks = element_line(colour="white"),#element_blank(),
plot.margin = unit(c(0.5,0,0,0), "lines")) +
labs(x="",y="") +
coord_cartesian(xlim=c(1,2.5))
grid.arrange(data_table_left1D, p2D,widths=c(5,3))
dev.off()
Es _sure_ sieht aus wie der ggplot auf der linken Seite immer noch große Gitterlinien gesetzt hat. Wir wären in der Lage, wirklich zu helfen, wenn der tatsächliche Code gegen die Themenbits gepostet wird. Wir haben keine Ahnung, wo sonst Sie die Möglichkeit haben könnten, dass sich große Gitterlinien wieder einschleichen. – hrbrmstr
Ich glaube nicht, dass es eine Gitternetzlinie ist - ich denke, es hat etwas damit zu tun, wie R auf Quarz rendert Mac-- – HanzMoleman
Ich benutze einen Mac und das ist _alot_ von wirklich interessant formatiertem Code. Ich bin mir nicht sicher, ob Sie [this] (http://stackoverflow.com/questions/5963269/how-to-make-a-great-r-reproducible-example) bereits gesehen haben, aber es hilft Ihnen zu erklären, wie Sie in der R arbeiten Seite des SO Q & A-Forums. – hrbrmstr