Wie fügt man Standardfehlerbalken zu einem Box- und Whisker-Plot mit ggplot2 hinzu?

Question

Ich versuche Standardfehlerbalken, um meine Daten zu den auf den Box-Plots in der Nähe des Endes der Antwort auf diese Frage gesehen sehr ähnlich hinzuzufügen: https://stats.stackexchange.com/questions/8137/how-to-add-horizontal-lines-to-ggplot2-boxplot

Ich bin mit dem Pflanzenbau-Datensatz, die wie folgt aussieht (mit Ausnahme von 30 Zeilen lang insgesamt):

weight group 
1 4.17  ctrl 
2 5.58  ctrl 
3 4.81  trt1 
4 4.17  trt1 
5 6.31  trt2 
6 5.12  trt2 

ich dieses Grundstück produziert haben

mit dem folgenden Code

Ich weiß nicht, wie Sie eine Fehlerleiste für jedes Diagramm basierend auf der Variation innerhalb dieser Faktorvariablen hinzufügen. Ich habe +geom_errorbar(aes(x=group, ymin=mean-sd, ymax=mean+sd)) hinzugefügt, aber es gibt den Fehler "Fehler im Mittelwert - SD: nicht-numerisches Argument zum binären Operator"

Jede Hilfe wäre willkommen. Danke

Answer 1

Es gibt eine mean_se Funktion in ggplot2, die genau das tut, was Sie wollen.

library(ggplot2) 
ggplot(PlantGrowth, aes(group, weight))+ 
    stat_boxplot(aes(group, weight), 
    geom='errorbar', linetype=1, width=0.5)+ #whiskers 
    geom_boxplot(aes(group, weight),outlier.shape=1) +  
    stat_summary(fun.y=mean, geom="point", size=2) + 
    stat_summary(fun.data = mean_se, geom = "errorbar")