Rjava kann nicht in R 3.0 unter Ubuntu installiert werden. 13.04

Ich kann rJava nicht in R 3.0 anrufen. Ich habe die folgende MeldungRjava kann nicht in R 3.0 unter Ubuntu installiert werden. 13.04

Error: package ‘rJava’ was built before R 3.0.0: please re-install it

Ich erhalte Fehler, als ich versuchte rJava Paket neu zu installieren. Ich habe die Ausgabe von R CMD javareconf

bereitgestellt

Java interpreter : /usr/bin/java 
Java version  : 1.7.0_21 
Java home path : /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre 
Java compiler : /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre/../bin/javac 
Java headers gen.: /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre/../bin/javah 
Java archive tool: /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre/../bin/jar 

trying to compile and link a JNI progam 
detected JNI cpp flags : 
detected JNI linker flags : 
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG  -fpic -O2 -pipe -g -c conftest.c -o conftest.o 
conftest.c:1:17: fatal error: jni.h: No such file or directory 
compilation terminated. 
make: *** [conftest.o] Error 1 
Unable to compile a JNI program 


Java library path: 
JNI cpp flags : 
JNI linker flags : 
Updating Java configuration in /usr/lib/R 
Done.

Ich bin mit Ubuntu 13.04. Ich versuchte auch apt-get install r-cran-rjava, die nicht hilft, das Problem zu lösen. In Bezug auf jni.h gab es eine Lösung here. Aber nicht sicher, wie kann ich die Lösung hier verwenden.

Quelle

2013-05-08 vinux

Ich lief genau das gleiche Problem. Meine Lösung war die openjdk-7- * via

sudo apt-get install openjdk-7-*

Gefolgt dass mit

sudo R CMD javareconf

und ich war dann in der Lage zu installieren rjava in R über install.packages("rJava") zu installieren.

Während vielleicht nicht die eleganteste Lösung scheint es, meine Probleme mit rJava zu arbeiten gelöst zu haben.

Quelle

2013-05-09 02:30:57 Peter

Vielen Dank. Es funktionierte. Ich habe versucht, Java gestern zu installieren. Ich versuchte auch Oracle Java, aber nicht funktioniert. Nicht sicher, ob ich JRE installiert habe oder den Neustart durchgeführt habe. – vinux

kein Glück für mich: erste zwei Schritte ohne Fehler ausgeführt, dann auf 'install.packages' erhalte ich:' Fehler: nicht in der Lage gemeinsam genutztes Objekt zu laden ‚/home/cboettig/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0 /rJava/libs/rJava.so ': '' libjvm.so: Datei kann nicht geöffnet werden: Keine solche Datei oder kein Verzeichnis'. Irgendwelche Ideen? – cboettig

Ich stieß auf das gleiche Problem - hat nicht funktioniert. Endlich fand ich, dass ich nach der Installation von Java 1.7 Ubuntu mitteilen musste, dass ich das standardmäßig verwenden soll - siehe [hier] (http://askubuntu.com/questions/64329/how-to-replace-openjdk-6-with-openjdk- 7) - Verwenden von 'update-java-alternatives -l', um die Liste der installierten Java-Versionen zu erhalten, und' sudo update-java-alternatives -s java-1.7.0-openjdk-i386' auf den Standardwert 1.7. Danach lief 'sudo R CMD javareconf' ohne Fehler und ich konnte' install.packages ("rJava") ' – JohnSG

Für diejenigen, die Störung zu erhalten:

error: unable to load shared object '/some/dir/rJava/libs/rJava.so': libjvm.so: 
cannot open shared object file: No such file or directory

ich den Fehler behoben, die Bibliothek im System lokalisieren und deren Verknüpfung mit /usr/lib:

$sudo updatedb 
$locate libjvm.so 
/usr/lib/debug/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so 
/usr/lib/debug/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/zero/libjvm.so 
/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/jamvm/libjvm.so 
/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so 
/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/zero/libjvm.so 
$sudo ln -s /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so /usr/lib/

Quelle

2014-02-01 22:12:34 kahlo

Installation rjava von den Verteilungspaketen wie in this askUbuntu answer vorgeschlagen funktioniert auch:

sudo apt-get install r-cran-rjava

N OTE: versucht von einem Debian-System.

Quelle

2017-08-29 21:10:03 atfornes

Rjava kann nicht in R 3.0 unter Ubuntu installiert werden. 13.04

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