Probleme mit dem Versuch, Rgdal-Paket in R unter Linux

Question

Ich versuche, die R (R Version 3.2.4 überarbeitete) Paket 'rgdal' auf meinem Linux, Ubuntu 14.04 zu installieren, aber das Paket hat Schwierigkeiten, wenn es versucht Abhängigkeiten zu laden, insbesondere sqlite.

Der Fehler ist wie folgt:

checking for gdal.h... yes 
checking gdal: linking with --libs only... no 
checking gdal: linking with --libs and --dep-libs... no 
/usr/lib/libgdal.so: undefined reference to `sqlite3_column_table_name' 
collect2: error: ld returned 1 exit status 

I GDAL/OGR gemäß den Anweisungen aktualisiert here, weil ich dachte, dass das Problem sein kann. Nun, wenn ich schreibe gdalinfo oder ogrinfo in das Terminal ein ähnlicher Fehler angezeigt:

gdalinfo: symbol lookup error: /usr/lib/libgdal.so.1: undefined 
symbol: sqlite3_column_table_name 

Wenn ich in meinem usr aussehen/local/lib die folgenden SQLite-Bibliotheken vorhanden sind:

libsqlite3.a libsqlite3.la libsqlite3.so libsqlite3.so.0 
libsqlite3.so.0.8.6 

Das Komische ist, dass dieses Paket in R letzte Woche gut funktionierte und jetzt kaputt ist ...

Jede Hilfe wird geschätzt! Vielen Dank.

-Caitlin

Answer 1

Klingt wie ein Problem mit dieser gemeinsam genutzten Bibliothek, hat installieren/aktualisieren, etwas in Ihrem System ohne Ihren Paket-Manager? (Ich glaube, es ist apt?)

Die libgdal.so.1 in Ihrem System wurde gegen einige Version der Bibliotheken libsqlite kompiliert, die jetzt, nachdem Sie etwas anderes aktualisiert haben, geändert haben, aber libgdal ist immer noch die gleiche Datei.

Ich habe nie Ubuntu, aber in der Linux-i verwenden (Bogen) ist dies der Grund, teilweise Updates entmutigt werden (wie nur ein Programm zu aktualisieren, zum Beispiel)

So würde ich empfehlen, ein komplettes System zu versuchen, update oder zumindest die sqlite-Bibliotheken aktualisieren.