2009-03-19 7 views
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Ich versuche, den Ausdruck für eine Wahrscheinlichkeitsverteilung (in Bezug auf Bioinformatik) zu erarbeiten, und habe Probleme beim Kombinieren der Informationen über eine Zufallsvariable aus zwei verschiedenen Quellen. Im Wesentlichen ist hier das Szenario: Es gibt 3 diskrete Zufallsvariablen X, A & B. X hängt von A und B. A und B sind nur durch X verwandt, dh A und B sind unabhängig gegeben X. Nun habe ich abgeleitet die Ausdrücke für: P (X, A) und P (X, B). Ich muss P (X, A, B) berechnen - das ist keine einfache Anwendung der Kettenregel.Kombinieren gemeinsamer Wahrscheinlichkeiten

Ich kann P (X | A) aus dem ersten Ausdruck ableiten, da P (A) verfügbar ist. B wird niemals unabhängig von A beobachtet, P (B) ist nicht leicht verfügbar - bestenfalls kann ich es annähern, indem ich über A marginalisiere, aber der Ausdruck P (A, B) hat keine geschlossene Form, so dass die Integration schwierig ist.

Irgendwelche Gedanken darüber, wie P (X, A, B) abgeleitet werden, ohne Informationen zu verwerfen? Vielen Dank im Voraus.

Amit

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Jede Wahrscheinlichkeitsarbeit, die ich je gemacht habe, war im Zusammenhang mit der Entwicklung von Software. Daher verstehe ich nicht, warum irgendjemand dafür stimmen würde, diese Frage zu schließen. –

Antwort

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Sie haben es hier mit einer ungerichteten azyklischen Grafik zu tun. A ist bedingt unabhängig von B gegeben X, aber X hängt (ich nehme direkt an) auf A und B. Ich bin ein wenig verwirrt über die Art Ihres Problems, dh, in welcher Form Ihre Wahrscheinlichkeitsverteilungen angegeben sind, aber Sie könnten schauen belief propagation.

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Vielen Dank. Ich fand einen reaally nützlichen Vortrag über Belief Propagation - http://mlg.eng.cam.ac.uk/teaching/4f13/0708/lect05.pdf ich Belief Propagation an der Uni studiert hatte (vor einiger Zeit jetzt), Aber es ist mir nie in den Sinn gekommen, es hier zu benutzen. – user80012

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Ok, es war eine lange Zeit, da ich die gemeinsamen Wahrscheinlichkeiten so nehmen diese mit einem großen Körnchen Salz, aber den ersten Platz gemacht habe würde ich anfangen zu suchen, da A und B orthogonal ist für einen Ausdruck etwas wie:

P (X, A, B) = P (X, A) + (P (X, B) * (1-P (X, A)));

Auch dies ist einfach eine Idee zu geben, zu erkunden, da es eine sehr lange Zeit, seit ich diese Art von Arbeit haben!

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Ihre Frage ist sehr unklar, in Hinblick darauf, was Sie beobachten, und was sind Unbekannte. Es scheint, als ob die einzige Tatsache, die Sie klar angeben, A und B sind unabhängig voneinander X. Das heißt

Annahme: P (A, B | X) = P (A | X) P (B | X)

Daher gilt: P (A, B, X) = P (A, B | X) P (X) = P (A | X) P (B | X) P (X) = P (A, X) P (X) = P (B, X) P (X)

Treffen Sie Ihre Wahl von Faktorisierungen.

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Das Problem besteht darin, die genetische Information im Vater eines Kindes abzuleiten, angesichts der genetischen Zusammensetzung von Mutter und Kind. X ist das Genom des Kindes, während A & B die Eltern sind. Wir haben B beobachtet und haben eine Verteilung für A. Genetische Vererbungsregeln, die uns P (X, A) und P (X, B) ableiten lassen. – user80012

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dsimchas Tipp über Glaubensnetzwerke erwies sich als sehr nützlich - die ganze Theorie scheint für dieses Szenario maßgeschneidert zu sein! Vielen Dank. – user80012