Speicher Pandas Objekte mit regelmäßigen Python-Objekten in HDF5 entlang

Question

Pandas ein nice interface hat, die die Speicherung Dinge wie Dataframes und Serie in einem HDF5 erleichtert:

random_matrix = np.random.random_integers(0,10, m_size) 
my_dataframe = pd.DataFrame(random_matrix) 

store = pd.HDFStore('some_file.h5',complevel=9, complib='bzip2') 
store['my_dataframe'] = my_dataframe 
store.close() 

Aber wenn ich versuche, einige anderen regelmäßigen Python-Objekte in derselben zu speichern Datei, es klagt:

my_dictionary = dict() 
my_dictionary['a'] = 2   # <--- ERROR 
my_dictionary['b'] = [2,3,4] 

store['my_dictionary'] = my_dictionary 
store.close() 

mit

TypeError: cannot properly create the storer for: [_TYPE_MAP] [group->/par 
ameters (Group) u'',value-><type 'dict'>,table->None,append->False,kwargs- 
>{}]         

Wie kann ich stor E regelmäßige Python-Datenstrukturen in der gleichen HDF5, wo ich andere Pandas-Objekte speichern?

Answer 1

Hier ist das Beispiel aus dem Kochbuch: http://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/cookbook.html#hdfstore

Sie beliebige Objekte als Attribute eines Knotens speichern kann. Ich glaube es gibt ein 64kb Limit (ich denke seine Gesamtattributdaten für diesen Knoten). Die Objekte sind gebeizt

In [1]: df = DataFrame(np.random.randn(8,3)) 

In [2]: store = HDFStore('test.h5') 

In [3]: store['df'] = df 

# you can store an arbitrary python object via pickle 
In [4]: store.get_storer('df').attrs.my_attribute = dict(A = 10) 

In [5]: store.get_storer('df').attrs.my_attribute 
{'A': 10}