Cython: dynamische "cdef extern von xxx"

Question

Ich versuche, direkten Zugriff auf numpy Funktionen random/randomkit.h, Zufallsgeneratoren in einer Multithread-Anwendung mit Cython (d. H. Ohne die Gil) zu verwenden.

Zu diesem Zweck Ich versuche, die Header-Datei aus numpy Ordnern mit dem folgenden Code zuzugreifen:

import os 
import numpy 

str_rkdir = os.path.dirname(os.path.abspath(numpy.__file__)) 
str_randomkit_h = str_rkdir + "/random/randomkit.h" 

cdef extern from str_randomkit_h: 
    ctypedef struct rk_state 
    cdef unsigned long rk_random(rk_state * state) nogil 
    cdef signed long rk_gauss(rk_state * state) nogil 
    cdef void rk_seed(unsigned long seed, rk_state * state) nogil 

Allerdings funktioniert das nicht mit pyximport weil cython der str_randomkit_h String beklagt (Ich denke, es doesn interpretiere den Python-Code nicht vor dem Kompilieren ... gibt es einen einfachen Weg dazu?

Als eine dreckige Workaround, bin ich dynamisch generieren die .pxd vor der Cython-Compilation, aber das ist nicht wirklich nett, so dass ich mich fragte, ob es einen besseren Weg, es zu tun war.

Answer 1

Dynamisch können Sie es nicht so arbeiten, weil, wie Sie auch sagten, es kein Dolmetschen gibt, nur kompilieren. DEF s wird auch nicht helfen, da die Funktionen, die in der Vorverarbeitungsstufe verwendet werden können, begrenzt sind. Ich glaube nicht, dass es einen anderen hinterhältigen Weg gibt, dies zu tun; Sie müssen pyximport oder setup.py Skript verwenden.

Mit pyximport können Sie der install-Funktion entsprechende Argumente liefern. Das Verzeichnis/ies die Include-Datei (en) enthält, kann mit der Taste 'include_dirs' im setup_args Wörterbuch als Wert angegeben werden:

>>> from numpy import random as rnd  
>>> from pyximport import install 
>>> install(setup_args={'include_dirs':rnd.__path__[0] + '/'}) 

Natürlich tut dies bedeutet, dass Sie auch Ihre .pxd Datei ändern die Header-Namen zu liefern als Stringliteral:

cdef extern from "randomkit.h": 
    ... 

Alternativ ist using a setup script ziemlich einfach. Auch hier liefern Sie einfach die include_dirs nach der Berechnung in irgendeiner Weise.