Fehler beim Installieren von Hmisc in R 3.3.0 auf Centos 6.7

Question

Ich habe R 3.3.0 auf einem Centos 5.2 Server installiert und versuche, die Pakete zu installieren, die ich benötige, um eine shiny App auszuführen; Eines der Pakete ist Hmisc und verursacht einen Fehler.

Leider habe ich keine Ahnung, wie es weiter geht. Könnte jemand bitte beraten? Muss ich zusätzliche Bibliotheken über yum install hinzufügen?

Vielen Dank

gcc: /builddir/build/BUILD/R-3.3.0/zlib-1.2.8/target/usr/lib64/libz.a: Keine solche Datei oder das Verzeichnis
gcc: /builddir/build/BUILD/R-3.3.0/bzip2-1.0.6/target/usr/lib64/libbz2.a: Keine solche Datei oder kein Verzeichnis
gcc: /builddir/build/BUILD/R-3.3 .0/xz-5.2.2/target/usr/lib64/liblzma.a: Keine solche Datei oder kein Verzeichnis
gcc: /builddir/build/BUILD/R-3.3.0/pcre-8.38/target/usr/lib64 /libpcre.a: Keine solche Datei oder kein Verzeichnis
gcc: /builddir/build/BUILD/R-3.3.0/curl-7.48. 0/target/usr/lib64/libcurl.a: Keine solche Datei oder das Verzeichnis

> sessionInfo() 
R version 3.3.0 (2016-05-03) 
Platform: x86_64-redhat-linux-gnu (64-bit) 
Running under: CentOS release 6.7 (Final) 

locale: 
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8  LC_NUMERIC=C    
[3] LC_TIME=en_US.UTF-8  LC_COLLATE=en_US.UTF-8  
[5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8 
[7] LC_PAPER=en_US.UTF-8  LC_NAME=C     
[9] LC_ADDRESS=C    LC_TELEPHONE=C    
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C  

attached base packages: 
[1] stats  graphics grDevices utils  datasets methods base  

loaded via a namespace (and not attached): 
[1] tools_3.3.0 

Answer 1

Das ist für mich mit dem gleichen Problem gearbeitet, es ist ein Hack, aber immer noch gearbeitet.

wget http://zlib.net/zlib-1.2.8.tar.gz 
./configure ; make ; make install 
mkdir -p /builddir/build/BUILD/R-3.3.0/zlib-1.2.8/target/usr/lib64/ 
ln -s /usr/local/lib/libz.a /builddir/build/BUILD/R-3.3.0/zlib-1.2.8/target/usr/lib64/libz.a 

wget http://www.bzip.org/1.0.6/bzip2-1.0.6.tar.gz 
make ; make install 
mkdir -p /builddir/build/BUILD/R-3.3.0/bzip2-1.0.6/target/usr/lib64/ 
ln -s /usr/local/lib/libbz2.a /builddir/build/BUILD/R-3.3.0/bzip2-1.0.6/target/usr/lib64/libbz2.a 

wget http://tukaani.org/xz/xz-5.2.2.tar.gz 
./configure ; make ; make install 
mkdir -p /builddir/build/BUILD/R-3.3.0/xz-5.2.2/target/usr/lib64/ 
ln -s /usr/local/lib/liblzma.a /builddir/build/BUILD/R-3.3.0/xz-5.2.2/target/usr/lib64/liblzma.a 

wget http://downloads.sourceforge.net/project/pcre/pcre/8.38/pcre-8.38.tar.gz 
./configure ; make ; make install 
mkdir -p /builddir/build/BUILD/R-3.3.0/pcre-8.38/target/usr/lib64/ 
ln -s /usr/local/lib/libpcre.a /builddir/build/BUILD/R-3.3.0/pcre-8.38/target/usr/lib64/libpcre.a 

wget https://curl.haxx.se/download/curl-7.48.0.tar.gz 
./configure ; make ; make install 
mkdir -p /builddir/build/BUILD/R-3.3.0/curl-7.48.0/target/usr/lib64/ 
ln -s /usr/local/lib/libcurl.a /builddir/build/BUILD/R-3.3.0/curl-7.48.0/target/usr/lib64/libcurl.a 

    yum install libidn-devel.i686 libidn-devel.x86_64 libssh-devel.x86_64 libssh-devel.i686 libssh2-devel.i686 libssh2-devel.x86_64 openldap-devel.i686 openldap-devel.x86_64 

R 
install.packages("Hmisc") 

> library(Hmisc) 
Loading required package: lattice 
Loading required package: survival 
Loading required package: Formula 
Loading required package: ggplot2 

Attaching package: ‘Hmisc’ 

The following objects are masked from ‘package:base’: 

    format.pval, round.POSIXt, trunc.POSIXt, units 

>