Ich habe folgende Beispieldaten:Wie fügt man mehr zu einer Heatmap.2 Plot mit dem Png-Gerät?
sel = structure(c(1.29955, 2.52295, 1.11021, 2.52008, 8.20255, 8.50118,
5.82189, 5.8108, 1.55928, 8.2552, 5.25119, 5.55055, 1.22525,
3.152, 3.9299, 5.50921, 5.25591, 5.11218, 1.55951, 2.5525,
9.2358, 2.0928, 5.2538, 2.5539, 8.52592, 2.59521, 5.55858,
5.92955, 2.22089, 1.52105),
.Dim = c(10L, 3L), .Dimnames = list(c("a", "b",
"c", "d", "e", "f", "g", "h",
"i", "j"), c("Label.1", "Label.2", "Label.3")))
Und ich diesen Code verwenden, die Figur zu zeichnen:
col = c("#FF0000", "#FF0000", "#FF0000")
par(mar=c(7,4,4,2)+0.1)
png(filename='test.png', width=800, height=750)
heatmap.2(sel, col=redgreen(75), scale="row", ColSideColors=col,
key=TRUE, symkey=FALSE, density.info="none", trace="none")
graphics.off()
Was mich dieses Heatmap gibt:
Wie Sie kann sehen, die X-Achsen-Etiketten sind abgeschnitten. Ich habe versucht, die Ränder größer mit par(mar=c(7,4,4,2)+0.1)
(von der Standardeinstellung par(mar=c(5,4,4,2)+0.1)
), aber das ändert sich nicht, wie das Etikett abgeschnitten wird.
ich die lmat
, lhei
und lwid
Optionen in heatmap.2 versucht zu ändern, so dass es ist:
heatmap.2(zebrafishSel, col=redgreen(75), scale="row", ColSideColors=zebracolors,
key=TRUE, symkey=FALSE, density.info="none", trace="none",
lmat=rbind(c(2),c(3),c(1),c(4)),
lhei=c(1,1,9,0),
lwid=c(1))
aber das gibt den Fehler Error in plot.new() : outer margins too large (figure region too small)
Wie kann ich die Marge mit heatmap.2 und png vergrößern Gerät?
perfekt. nicht in der Dokumentation für diese Funktion aus irgendeinem Grund. Vielen Dank – Luke