Installieren rpy2 mit benutzerdefinierter R Installation

Question

I in

~/R-3.2.2/ist eine benutzerdefinierte Installation von R/

Als ich

sudo pip install rpy2 

laufe ich

Warning: Tried to guess R's HOME but no command (R) in the PATH. 
Traceback (most recent call last): 
    File "<string>", line 17, in <module> 
    File "/tmp/pip-build-ITKmkR/rpy2/setup.py", line 330, in <module> 
    ri_ext = getRinterface_ext() 
    File "/tmp/pip-build-ITKmkR/rpy2/setup.py", line 231, in getRinterface_ext 
    r_home = _get_r_home() 
    File "/tmp/pip-build-ITKmkR/rpy2/setup.py", line 63, in _get_r_home 
    r_home = r_home.split(os.linesep) 
UnboundLocalError: local variable 'r_home' referenced before assignment 

Ich habe keine Antwort auf dieses Problem gefunden, obwohl es in mehreren Posts erscheint. Hier ist, was ich versucht

• die R ausführbare zum

  PATH

  export PATH = $ PATH: /home/R-3.2.2/bin/ nicht

• Export funktionierte R_HOME mit dem gleichen Wert: funktionierte nicht

• echo export PATH=$PATH:/home/R-3.2.2/bin/ >> ~/.bashrc source ~/.bashrc

hat nicht funktioniert.

Auf der anderen Seite des "Problem" scheint hier gelöst https://bitbucket.org/rpy2/rpy2/issues/283/rpy2-installation-error-when-r-output

Wie rpy2 richtig installieren?

Answer 1

Der Fehler ist wegen einer issue in rpy2 (nur behoben). Andernfalls kann es sein, dass R entweder nicht im PATH ist, wie Sie denken, oder Sie haben keine Berechtigung, es auszuführen.

Versuchen:

# assert that the R executable is where you think it is 
~/R-3.2.2/bin/R --version 
# set the PATH 
export PATH=${PATH}:~/R-3.2.2/bin/ 
# unset R_HOME if needed 
unset R_HOME 
# install rpy2 
pip install rpy2