Mehrere partielle Abhängigkeit Plots in einem Diagramm

Question

Ich verwende das randomForest Paket mit der Partialplot function.

Ich möchte mehrere partielle Abhängigkeit Plots in einem Diagramm machen. Mein Thesis Promoter hat mir gesagt, dass es möglich ist, sie zu speichern (in der Umgebung habe ich das gemacht und ich habe ein Listenobjekt mit 'x' und 'y' Variablen in dieser Liste), aber ich weiß nicht, wie ich mich erinnern soll Grafik nach dem Speichern.

Was ich tun möchte, ist:

1. Speichern PD Plots

2. Rückruf sie

3. Plot mehrere PDP in einem Diagramm

Answer 1

Verwenden Sie anstelle der partialPlot Funktion die plotmo Funktion in der plotmo Paket. Dies wird Plots für alle Variablen und Variablenpaare auf einer einzelnen Seite zeichnen. Zum Beispiel:

library(randomForest) 
data(trees) 
mod <- randomForest(Volume~., data=trees) 
library(plotmo) 
plotmo(mod, pmethod="partdep") # plot partial dependencies 

die gibt

plot http://www.milbo.org/doc/plotmo-randomforest-trees.png

Sie genau angeben können, die variabel und variable Paare erhalten geplottet plotmo des all1, all2, degree1 und degree2 Argumente verwenden. Weitere Beispiele finden sich in der vignette for the plotmo package.

Answer 2

Verwenden Sie das Paket pdp. Beispiele sind in der Veröffentlichung angegeben: https://journal.r-project.org/archive/2017/RJ-2017-016/RJ-2017-016.pdf.