Looping die Zeichen einer Zeile jedes zu erhalten, aber mit Indexerror: string Index außerhalb des zulässigen Bereichs

Question

ich den folgenden Code

import sys 

from collections import defaultdict 

filename = sys.argv[1] 

g = defaultdict(list) 

l = 0 

with open(filename) as graph_file: 
    for line in graph_file: 
     for pos in line: 
      g[l].append(pos[0]) 
      g[l].append(pos[1]) 

      g[l+1].append(pos[1]) 
      g[l+1].append(pos[2]) 

     l = l+1 

for i in g.keys(): 
    if '\n' in g[i]: 
     g[i].remove('\n') 

for i in g.keys(): 
    print (i, g[i]) 

Wenn ich das cmd verwenden, das Programm auszuführen, habe ich die folgende Fehlermeldung und Ich kann nicht verstehen warum.

Traceback (letzter Anruf zuletzt): File "test.py", Zeile 15, in g [L] .append (po [1]) Indexerror: string-Index außerhalb des Bereichs

I Ich weiß, was es bedeutet, aber ich kann nicht verstehen, warum es passiert. Die Textdatei, die ich versuche das zu öffnen, folgende:

ATA 
GTG 
TAC 
ACC 
AAG 
CCA 
TGG 
GTA 
TAT 
ATG 
TGT 
AGT 
GGA 
GAC 
ACT 
CTT 
TTC 
CAA 
TCA 
CAT 

Answer 1

Ihr Problem ist, dass, wenn Sie eine Schleife über mit for pos in line, Sie Looping im wesentlichen über for pos in 'ATA', die erste Zeile nehmen. Daher wird pos zuerst 'A' zugewiesen, wodurch ein Fehler ausgelöst wird, wenn Sie versuchen, auf das zweite Element in diesem Objekt zuzugreifen - Sie durchlaufen einmal zu viele Schleifen.

Stattdessen Ihr Code wie folgt ändern:

import sys 

from collections import defaultdict 

filename = sys.argv[1] 

g = defaultdict(list) 

l = 0 

with open(filename) as graph_file: 
    for line in graph_file: 
     g[l].append(line[0]) 
     g[l].append(line[1]) 
     g[l+1].append(line[1]) 
     g[l+1].append(line[2]) 

     l = l+1 

for i in g.keys(): 
    if '\n' in g[i]: 
     g[i].remove('\n') 

for i in g.keys(): 
    print (i, g[i]) 

---

bash-3.2$ python foo.py foo.txt 
(0, ['A', 'T']) 
(1, ['T', 'A', 'G', 'T']) 
(2, ['T', 'G', 'T', 'A']) 
(3, ['A', 'C', 'A', 'C']) 
(4, ['C', 'C', 'A', 'A']) 
(5, ['A', 'G', 'C', 'C']) 
(6, ['C', 'A', 'T', 'G']) 
(7, ['G', 'G', 'G', 'T']) 
(8, ['T', 'A', 'T', 'A']) 
(9, ['A', 'T', 'A', 'T']) 
(10, ['T', 'G', 'T', 'G']) 
(11, ['G', 'T', 'A', 'G']) 
(12, ['G', 'T', 'G', 'G']) 
(13, ['G', 'A', 'G', 'A']) 
(14, ['A', 'C', 'A', 'C']) 
(15, ['C', 'T', 'C', 'T']) 
(16, ['T', 'T', 'T', 'T']) 
(17, ['T', 'C', 'C', 'A']) 
(18, ['A', 'A', 'T', 'C']) 
(19, ['C', 'A', 'C', 'A']) 
(20, ['A', 'T']) 
bash-3.2$