Arbeiten mit Rstudio für das Schreiben von Thesis-Kapiteln in .Rnw

Question

Ich habe 2 Dateien von meiner Universität für das Schreiben von These mit LaTeX bekommen. Eine ist eine .sty-Datei und eine andere ist die .TeX-Datei. Um in R Studio zu arbeiten, habe ich beschlossen, separate. Rnw-Dateien für jedes Kapitel und eine Datei für die Kombination aller Kapitel zu haben. Ich denke .TeX-Datei ist die eine, wo ich alle Kapitel kombinieren kann, weil es Beispielkapitel in der Ausgabe gibt. Auf der Website von R studio gibt es eine Seite mit dem Titel "Arbeiten mit mehreren RNW-Dateien", die diesen Prozess beschreibt (ich denke), aber mir nicht klar ist. Es handelt von "Kinder" -Dateien, die ich in meinem Fall für die Kapitel halte. Meine einfache Frage ist also, dass ich, wenn ich für jedes Kapitel verschiedene .RNW-Dateien erstelle, wie kann ich R bitten, sie in einer TeX-Datei zu kombinieren, die mir von der Universität zur Verfügung gestellt wurde? Bitte trage meine Unwissenheit, denn ich bin neu in reproduzierbarem Forschungsmaterial.

Answer 1

Angenommen, Sie verwenden Knitr (und ich empfehle Knitr über Sweave) die einfache Möglichkeit, dies zu tun ist mit der childchunk option.

Als Beispiel sagen Sie 2 Kapitel haben, hielten in Dateien chap1.Rnw und chap2.Rnw und ein Master-Dokument thesis.Rnw (mit Datei-Hochschulart thesisStyle genannt). Sie können diese alle zusammen, innerhalb thesis.Rnw setzen - vorausgesetzt, diese sind alle im gleichen Verzeichnis sind - über:

\documentclass{article} 
\usepackage{thesisStyle} 

\begin{document} 
% "include" chapter 1 
<<chap1, child='chapt1.Rnw'>>= 
@ 

% again with chapter 2 
<<chap2, child='chap2.Rnw'>>= 
@ 

\end{document} 

Dann haben RStudio nur thesis.Rnw kompilieren und es wird thesis.tex ausspucken, die alles richtig zusammen gebündelt werden haben .

Das ist aber nicht alles! Sie können chap1.Rnw entwickeln, ohne dass Sie ihm eine eigene Präambel geben müssen. Das heißt, wenn der Gehalt an chap1.Rnw ist

<<echo=FALSE, cache=FALSE>>= 
set_parent('thesis.Rnw') 
@ 

\chapter{In a world where...} 
\section{Great voice actors in movie trailer history} 
ANYTHING YOU'D NORMALLY PUT IN AN .Rnw FILE 

dann Sie chap1.Rnw wie jede normale .Rnw Datei kompilieren und es wird die Präambel von thesis.Rnw nehmen vor dem Ausführen von was auch immer TeX-Backend Sie verwenden (normalerweise pdflatex oder xelatex). Insbesondere wird knitr die \documentclass{article} und \usepackage{thesisStyle} Zeilen an der Spitze chapt1.tex schlagen.

Ein Wort der Vorsicht, ich habe das Kind-Eltern-Modell in Knitr als weiß-Raum-empfindlich gefunden.Also, lesen Sie den Block keinen Platz haben

<<echo=FALSE, cache=FALSE>>= 
set_parent('thesis.Rnw') 
@ 

Answer 2

Sie haben ein paar Optionen.

Eine Möglichkeit besteht darin, jedes Ihrer Kapitel nur von Hand zu bearbeiten. Sie werden für jedes Kapitel eine .RNW-Datei haben, dann in Rstudio (oder R) die Funktion knit aus dem knitr-Paket ausführen (möglicherweise gibt es dazu eine Rstudio-Schaltfläche oder ein Menü), um Ihre .RNW-Datei in a zu konvertieren. Textdatei Dann verwenden Sie im übergeordneten LaTeX-Dokument einfach \include, um die .tex-Dateien für jedes Kapitel einzufügen. Dies bedeutet, dass Sie jedes Kapitel selbst bearbeiten müssen und es jedes Mal neu machen müssen, wenn Sie etwas ändern. Die andere Option besteht darin, Eltern- und Kinddokumente zu erstellen, die knitr automatisch verstehen und für Sie automatisch verarbeiten wird (Rstudio verwendet knitr, um die Verarbeitung von .tex- und eventuell .pdf-Dateien durchzuführen). Diese page verfügt über Demonstrationen zum Erstellen der Eltern- und Kinddokumente auf diese Weise, ändern Sie einfach die .tex-Datei, die Ihnen gegeben wurde, um die wichtigen Dinge in die Demos aufzunehmen (und wahrscheinlich den Namen in .RNW ändern). Stellen Sie sicher, dass die Dokumentklasse mit der angegebenen .sty-Datei übereinstimmt und die wichtigen Optionen aus der .tex-Datei erhalten bleiben, aber die untergeordneten Dokumente wie in der knitr-Demo angezeigt werden. Auf diese Weise können Sie das Dokument als Ganzes und nicht jedes einzelne Kapitel bearbeiten.