Morphologische Wasserscheide von Markern Filter auf ITK

Question

Ich versuche, mit den Bibliotheken von ITK eine Pipeline für die Bildsegmentierung zu erstellen. Aber wenn ich das ItkMorphologicalWatershedFromMarkersFilter anwende, ist das Ergebnis ein leeres Bild (binäres Bild mit nur 1en).

Kann jemand diesen Filter richtig anwenden?

Mein Eingabebild sollte der Gradient eines Bildes sein, und das Markierungsbild sollte das Ergebnis der Anwendung eines Wasserscheidenfilters auf demselben Bild sein.

Eingang image

Marker image

Und dies ist die Erklärung und die Anwendung des Filters:

typedef itk::MorphologicalWatershedFromMarkersImageFilter < OutputImageType, OutputImageType > 
     MorphologicalWatershedFromMarkersImageFilterType; 

MorphologicalWatershedFromMarkersImageFilterType::Pointer CwatershedFilter 
     = MorphologicalWatershedFromMarkersImageFilterType::New(); 


CwatershedFilter->SetInput1(reader1->GetOutput()); 
CwatershedFilter->SetMarkerImage(reader2->GetOutput()); 

CwatershedFilter->SetMarkWatershedLine(true); 

try{ 

    CwatershedFilter->Update(); 

} 
catch (itk::ExceptionObject & error) 
{ 
    std::cerr << "Error: " << error << std::endl; 
    getchar(); 
    return EXIT_FAILURE; 
} 

Auch dies ist der Link zu der Dokumentation dieses Filters von itk .org:

http://www.itk.org/Doxygen48/html/classitk_1_1MorphologicalWatershedFromMarkersImageFilter.html#a20e3b8de42219606ba759e822be0aaa2

Vielen Dank !!

Answer 1

Während nicht C++ ITK, gibt es eine SimpleITK Notebooks, die es Nutzung demonstriert:

http://insightsoftwareconsortium.github.io/SimpleITK-Notebooks/32_Watersheds_Segmentation.html

Ihr Markierungsbild nur binär ist, und kein Label Bild. Damit meine ich, dass Ihr Bild nur 0 und 1 (oder 255) ist. Im verknüpft Beispiel ist folgendes zu beachten:

min_img = sitk.RegionalMinima(feature_img, backgroundValue=0, foregroundValue=1.0, fullyConnected=False, flatIsMinima=True) 
marker_img = sitk.ConnectedComponent(min_img, fullyConnected=False) 

Die „min_img“ ist ein binäres Bild, aber dann wird das Bild mit dem „ConnectedComponent“ Bildfilter verarbeitet, die jede „Insel“ eine eindeutige Nummer gibt. Dies wird für das Marker- (oder Label-) Bild für den WatershedFromMarker-Filter erwartet.

Ich werde auch feststellen, dass Ihr Eingangsbild einige Grenzlinien hat, die Sie nicht als Eingabe möchten.