2012-08-10 11 views
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Ich versuche, eine Korrelationskarte zu visualisieren, und ich denke, dass ich es bis auf das Durcheinander der X-Achsenbeschriftungen zum Laufen gebracht habe. Irgendwelche Vorschläge, wie man sie dreht? Einige der Parameter für viele der Basis-R-Plots scheinen für Levelplots nicht verfügbar zu sein. Es ist möglich, dass ich nicht weiß, wovon ich rede.Wie man die X-Achsenbeschriftungen um 90 Grad in Levelplot dreht

Dies ist die Daten, die ich verwendet:

cor2<-structure(c(1, -0.0389681095266643, -0.0389681095266643, 0.178476154216706, 
-0.178476154216706, -0.168494117498168, -0.0531355593389041, 
-0.0627159607856109, -0.11922152176561, 0.00887070126495505, 
-0.0721998017906867, -0.140654273521441, 0.0257953297166468, 
-0.0504004052031319, -0.057270788080051, -0.0918121581058645, 
-0.0389681095266643, 1, 1, -0.207885482210833, 0.207885482210833, 
0.221906241587463, 0.285338260198777, 0.370743678038144, 0.219208701879567, 
0.266580102221828, 0.193378655575033, 0.23922965323291, 0.164352387360997, 
0.229607796224011, 0.184412911672718, -0.250294366329347, -0.0389681095266643, 
1, 1, -0.207885482210833, 0.207885482210833, 0.221906241587463, 
0.285338260198777, 0.370743678038144, 0.219208701879567, 0.266580102221828, 
0.193378655575033, 0.23922965323291, 0.164352387360997, 0.229607796224011, 
0.184412911672718, -0.250294366329347, 0.178476154216706, -0.207885482210833, 
-0.207885482210833, 1, -1, -0.836264694082863, 0.0968492347163521, 
-0.529206721168992, -0.368511719318385, -0.370488391611307, -0.446552321746797, 
-0.0946404317035884, -0.166601542941319, -0.371982811624152, 
-0.0551151773556682, -0.0252777576827408, -0.178476154216706, 
0.207885482210833, 0.207885482210833, -1, 1, 0.836264694082863, 
-0.0968492347163521, 0.529206721168992, 0.368511719318385, 0.370488391611307, 
0.446552321746797, 0.0946404317035884, 0.166601542941319, 0.371982811624152, 
0.0551151773556682, 0.0252777576827408, -0.168494117498168, 0.221906241587463, 
0.221906241587463, -0.836264694082863, 0.836264694082863, 1, 
-0.0484257163697656, 0.493261440648374, 0.421352971692481, 0.335283617372406, 
0.42535494057661, 0.0277745485055271, 0.0990554932499753, 0.268268745412774, 
0.106129159123147, 0.0645326205432567, -0.0531355593389041, 0.285338260198777, 
0.285338260198777, 0.0968492347163521, -0.0968492347163521, -0.0484257163697656, 
1, -0.525318257575221, -0.160726744335619, -0.530266513726872, 
-0.523896249354085, 0.0821688285842216, 0.120061871987285, -0.0462809753885581, 
0.0894673511307366, -0.157709074647179, -0.0627159607856109, 
0.370743678038144, 0.370743678038144, -0.529206721168992, 0.529206721168992, 
0.493261440648374, -0.525318257575221, 1, 0.450831181390043, 
0.894070902852474, 0.937461049803717, 0.120717838386174, 0.0922093724569894, 
0.421886104540215, 0.0686035045695465, -0.0259181463830899, -0.11922152176561, 
0.219208701879567, 0.219208701879567, -0.368511719318385, 0.368511719318385, 
0.421352971692481, -0.160726744335619, 0.450831181390043, 1, 
0.194931612275736, 0.475810998910999, 0.0674296214446775, 0.0665009602984884, 
0.181289860729344, -0.0399243218645222, -0.0918283721705961, 
0.00887070126495505, 0.266580102221828, 0.266580102221828, -0.370488391611307, 
0.370488391611307, 0.335283617372406, -0.530266513726872, 0.894070902852474, 
0.194931612275736, 1, 0.955425650934062, 0.0881868869011078, 
0.139156258136006, 0.310078412850343, 0.137566770975812, -0.0893525009590147, 
-0.0721998017906867, 0.193378655575033, 0.193378655575033, -0.446552321746797, 
0.446552321746797, 0.42535494057661, -0.523896249354085, 0.937461049803717, 
0.475810998910999, 0.955425650934062, 1, 0.0988326951129949, 
0.147058790355866, 0.336760945050752, 0.110616903520016, -0.107521647802021, 
-0.140654273521441, 0.23922965323291, 0.23922965323291, -0.0946404317035884, 
0.0946404317035884, 0.0277745485055271, 0.0821688285842216, 0.120717838386174, 
0.0674296214446775, 0.0881868869011078, 0.0988326951129949, 1, 
0.746502805562635, 0.144029358291222, 0.496146773442592, -0.464865772986093, 
0.0257953297166468, 0.164352387360997, 0.164352387360997, -0.166601542941319, 
0.166601542941319, 0.0990554932499753, 0.120061871987285, 0.0922093724569894, 
0.0665009602984884, 0.139156258136006, 0.147058790355866, 0.746502805562635, 
1, 0.068339761274059, 0.546006730280353, -0.392180163611345, 
-0.0504004052031319, 0.229607796224011, 0.229607796224011, -0.371982811624152, 
0.371982811624152, 0.268268745412774, -0.0462809753885581, 0.421886104540215, 
0.181289860729344, 0.310078412850343, 0.336760945050752, 0.144029358291222, 
0.068339761274059, 1, -0.118872875719514, 0.0250634712618911, 
-0.057270788080051, 0.184412911672718, 0.184412911672718, -0.0551151773556682, 
0.0551151773556682, 0.106129159123147, 0.0894673511307366, 0.0686035045695465, 
-0.0399243218645222, 0.137566770975812, 0.110616903520016, 0.496146773442592, 
0.546006730280353, -0.118872875719514, 1, -0.0649756207052158, 
-0.0918121581058645, -0.250294366329347, -0.250294366329347, 
-0.0252777576827408, 0.0252777576827408, 0.0645326205432567, 
-0.157709074647179, -0.0259181463830899, -0.0918283721705961, 
-0.0893525009590147, -0.107521647802021, -0.464865772986093, 
-0.392180163611345, 0.0250634712618911, -0.0649756207052158, 
1), .Dim = c(16L, 16L), .Dimnames = list(c("ID", "QnWeight_initial", 
"QnWeight_initial_mg", "Days_till_1st_Wrkr", "Days_before_max_Wrkr_Eclosion", 
"Wrkr_Eclosion_Bin", "QnMass_At_Wrkr_Eclosion", "ColonyMass_At_Wrkr_Eclosion", 
"Adult_Wrkrs_At_Wrkr_Eclosion", "Mature_Brood_At_Wrkr_Eclosion", 
"Sum_wrkrsPlusBrood_At_Wrkr_Eclosion", "QnMass_2wksLater", "QnMass_4wksLater", 
"ColonyMass_4wksLater", "QnMass_2mnthsLater", "ColonyMass_2mnthsLater" 
), c("ID", "QnWeight_initial", "QnWeight_initial_mg", "Days_till_1st_Wrkr", 
"Days_before_max_Wrkr_Eclosion", "Wrkr_Eclosion_Bin", "QnMass_At_Wrkr_Eclosion", 
"ColonyMass_At_Wrkr_Eclosion", "Adult_Wrkrs_At_Wrkr_Eclosion", 
"Mature_Brood_At_Wrkr_Eclosion", "Sum_wrkrsPlusBrood_At_Wrkr_Eclosion", 
"QnMass_2wksLater", "QnMass_4wksLater", "ColonyMass_4wksLater", 
"QnMass_2mnthsLater", "ColonyMass_2mnthsLater"))) 

Mein Code:

rgb.palette <- colorRampPalette(c("blue", "yellow"), space = "rgb") 
levelplot(cor2, aspect="iso", main="Correlation Matrix", xlab="", xaxt='n', ylab="", col.regions=rgb.palette(120), cuts=100, at=seq(0,1,0.01)) #, names.arg=paste(cor2[,1]),las=3 

#this is what I tried, and it didn't work. I couldn't get names(cor2) to work, but I guess that this is a separate question. 
labs<- (cor2[,0]) 
text(cex=1, x=x-0.25, y=-1.5, labs, xpd=TRUE, srt=90) 

##want something like this, but can't find an analogous way to remove axisnames and add text 
#x <- barplot(table(mtcars$cyl),axisnames=FALSE)#,xaxt="n" 
#labs <- paste(names(table(mtcars$cyl)), "cylinders") 
#text(cex=1, x=x-0.25, y=-1.5, labs, xpd=TRUE, srt=90) 
+1

Es sieht so aus, als müssten Sie tief in 'gitter' (und vielleicht' grid') graben, um dies zu tun. Für Anfänger wollen Sie die Gitterfunktion 'ltext()' anstelle der Basisgrafik 'text()'. Auch für die Labels benötigen Sie 'labs <- colnames (cor2)'. – bdemarest

Antwort

22

Was die Drehung der x-Achse Etiketten gehen, haben Sie scales Parameter verwenden (siehe ?xyplot für weitere Informationen über lattice Parameter). Sie möchten nur die x Komponente ändern: scales=list(x=list(rot=90)). Im Kontext:

levelplot(cor2, 
      aspect="iso", scales=list(x=list(rot=90)), 
      main="Correlation Matrix", col.regions=rgb.palette(120), 
      cuts=100, at=seq(0,1,0.01)) 
+0

hat funktioniert, super. Allerdings habe ich eine Frage: Warum müssen Sie die x-Waagen-Eigenschaft/-Liste angeben und tut: '' 'labelrotation = c (0, 90) Skalen = Liste (rot = Labelrotation)' '' nicht funktionieren, da die Rotation kann ein Vektor sein, der die Drehung für die x- und y-Achse angibt? –

+0

Das ist eine gute Frage (Sie sollten es vielleicht als richtige Frage stellen, um mehr Sichtbarkeit zu bekommen), auf die ich nicht sicher bin, wie ich antworten soll. Aus der Dokumentation las ich 'rot Winkel (in Grad), um den die Achsenbeschriftungen gedreht werden sollen. Kann ein Vektor der Länge 2 sein, um die linke/untere und rechte/obere Achse separat zu steuern. Das lässt mich denken, dass es kein ax/y-Vektor sein soll (sonst wäre es "links und unten" getrennt und nicht "links")/untere und rechte/obere Achse getrennt "). – plannapus