Aktualisierung von h5py Datasets

Question

Hat jemand eine Idee, hdf5-Datasets von h5py zu aktualisieren? Unter der Annahme, schaffen wir einen Datensatz wie:

import h5py 
import numpy 
f = h5py.File('myfile.hdf5') 
dset = f.create_dataset('mydataset', data=numpy.ones((2,2),"=i4")) 
new_dset_value=numpy.zeros((3,3),"=i4") 

Ist es möglich, die dset zu einem 3x3 numpy Array zu verlängern?

Answer 1

Sie müssen den Datensatz mit der Eigenschaft "erweiterbar" erstellen. Nach der erstmaligen Erstellung des Datasets ist dies nicht mehr möglich. Um dies zu tun, you need to use the "maxshape" keyword. Ein Wert von None im Tupel maxshape bedeutet, dass diese Dimension unbegrenzt groß sein kann. Also, wenn eine f HDF5 Datei:

dset = f.create_dataset('mydataset', (2,2), maxshape=(None,3)) 

erzeugt einen Datensatz mit einer Größe (2,2), die entlang der ersten Dimension auf unbestimmte Zeit verlängert werden kann und bis 3 entlang der zweiten. Jetzt können Sie den Datensatz mit resize erweitern:

dset.resize((3,3)) 
dset[:,:] = np.zeros((3,3),"=i4") 

Die erste Dimension kann so viel erhöht werden, wie Sie wollen:

dset.resize((10,3))