Galaxy NGS zeigt keine installierten Tools an

Question

Ich führe eine Instanz von Galaxy NGS auf einem Ubuntu-Server mit einer Basiskonfiguration, PostgreSQL-Datenbank und Apache.

Wenn ich melden Sie sich als Admin in der Galaxy-Schnittstelle, und versuchen, ein neues Werkzeug durch den Werkzeugschuppen hinzuzufügen, wird das Werkzeug installiert und ich kann es ohne Probleme

jedoch verwenden können, wenn Galaxy neu gestartet werden muss das Werkzeug wird nicht mehr

ich die Anweisungen here gefolgt, einen Ordner zu konfigurieren, dass die installierten Tools zu halten, wie es dort erklärt, eine Linie in config.ini mit dem gewünschten Ordner

tool_dependency_dir = dependency_dir 

Zugabe Aber Das macht den Trick nicht und die Tools werden sowieso nicht im Ordner gespeichert

Hat jemand eine Ahnung was ich vermissen könnte?

Answer 1

Das Problem wurde nach der Umstellung von Apache gelöst nginx, und die Änderung der Linie I

geschrieben

tool_dependency_dir = /home/galaxy/tool_deps 

ich eine nette Ressource gefunden, die mich mit der Konfiguration, falls jemand steht vor dem gleichen Problem geholfen.

https://wiki.galaxyproject.org/Events/BioITWorld2014/W14#Setting_up_a_Local_Galaxy_Tutorial_.28Part_I.29