Gibt es eine Möglichkeit Funktionen in einer Datei definiert nennen sagen myfunc.rAufrufe von benutzerdefinierten Funktionen aus Python mit rpy2
---------------myfunc.r --------------
myfunc = function(){
return(c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,10))
}
getname = function(){
return("chart title")
}
---- Python
How to call getname() here ?
Jede Hilfe wäre sehr geschätzt werden?
Sie können so etwas wie dieses (hier Python-Code) tun
import rpy2.robjects as robjects
robjects.r('''
source('myfunc.r')
''')
r_getname = robjects.globalenv['getname']
dann rufen Sie es
r_getname()
Dies funktionierte für mich noch 2016 mit 'R-3.2.2' und' rpy2 = 2.7.0' :) –
Das sind Funktionen in rpy2, die dabei helfen sollten machen sauberer als Objekte in den globalen Dumping Arbeitsplatz.
from rpy2.robjects.packages import STAP
# if rpy2 < 2.6.1 do:
# from rpy2.robjects.packages import SignatureTranslatedAnonymousPackage
# STAP = SignatureTranslatedAnonymousPackage
with open('myfunc.r', 'r') as f:
string = f.read()
myfunc = STAP(string, "myfunc")
Die Objekte in der R-Datei kann nun mit myfunc.myfunc und myfunc.getname zugegriffen werden.
Überprüfen Sie die Dokumentation über importing arbitrary R code as a package (ältere doc here).
'SignatureTranslatedAnonymousPackage' Der Name ist ein bisschen lang Ich denke..für R und Python Entwickler :) – agstudy
Ja , kann auf dem Java-Extravaganz Ende des Namensspektrums aber noch unter 140 Zeichen sein ;-). Ein kürzerer Klassenname würde bei gleichzeitiger Klarstellung ein Unterpaket einführen. Vorschläge für Namen sind ebenfalls willkommen. – lgautier
Natürlich kam ich aus der .net Welt und ich weiß was du meinst. rpy2 ist eine großartige Arbeit. Ich schätze. +1 .. langer Name aber saubere Lösung! Ich denke, Sie können einfach 'import SignatureTranslatedAnonymousPackage als STAP' zum Beispiel hinzufügen ... – agstudy
Ich würde vorschlagen, zu verwenden, was user3282437here vorgeschlagen:
import rpy2.robjects as robjects
r_source = robjects.r['source']
r_source('/path_to_file/myfunc.R')
r_getname = robjects.globalenv['getname']
Ich bin nicht sicher, dass es sich um ein globales Problem ist, aber auf meinem Windows-Rechner direkten Aufruf wie agstudy geraten:
import rpy2.robjects as robjects
robjects.r('source("some_file.R")')
führt zu Python-Absturz.
Warum definieren Sie 'myfunc' hier? – agstudy
@agstudy: nur ein Beispiel zeigt, dass die Datei mehrere Funktionen enthalten kann, denke ich. – lgautier