Ich habe ein Programm, das eine Liste von Aminosäuresequenzen für ein Protein in Influenza A durchläuft, das ich analysiere und Aminosäure an Position 627 findet in jeder Aminosäuresequenz in meiner FASTA-Datei für jedes Protein.Python 2.7 Geschachtelte If-Anweisung druckt kein String-Literal nach dem Drucken der Array-Position
arbeitet Mein Code wie dieser
with open(file, "r") as source:
for heading_and_lines in group_by_heading(source):
heading= heading_and_lines[0]
lines= heading_and_lines[1:]
lines = ''.join(lines)
if lines[627-1] == 'K':
print "---------------MUTATION BELOW--------------"
print heading
print lines[627-1]
#print "-------------------------------------------"
print "end of file"
Aber mein Code nicht Arbeit wie diese Aus irgendeinem Grund
with open(file, "r") as source:
for heading_and_lines in group_by_heading(source):
heading= heading_and_lines[0]
lines= heading_and_lines[1:]
lines = ''.join(lines)
if lines[627-1] == 'K':
print "---------------MUTATION BELOW--------------"
print heading
print lines[627-1]
print "-------------------------------------------"
print "end of file"
Drucken der Zeile unterhalb der Mutation, die ich zurückkehrt haben einen Fehler entdeckt, und unerwarteter Einzug Siehe Ich möchte die Linie unter jeder Mutation, genau wie die Linie oben, damit ich die Mutationen klar organisieren kann. Gibt es einen Grund, warum Sie glauben, dass die folgende Druckanweisung nicht funktioniert?
Sorry, wenn das Verwirrung klang, und wie immer danke für Ihre Zeit.
prüfen Tabs und Abstand. Wenn Sie beide in Ihrem Programm haben, wird es brechen. – TigerhawkT3
Wenn ich es zurückziehe, druckt es für jeden Stamm eine Zeile unten, wenn ich nur die folgende Zeile für Stämme drucken möchte, die die Mutation von Lysin haben (AKA eine Aminosäure 'K' Übereinstimmung) – SweetJD14
Darn. Ich habe gerade alle Abstände überprüft und es lässt mich einfach kein String-Literal drucken, nachdem ich die Aminosäure an Position [627-1] gedruckt habe. Aus irgendeinem Grund sagt es immer wieder einen unerwarteten Einzug. – SweetJD14