Konvertieren von Sequenzen in Codons

Question

Ich bin ein Noob und frage mich, was ist der effizienteste Weg, um eine DNA-Sequenz ATGGTGCCCCAG usw. in Codons zu konvertieren: ATG GTG CCC CAG. Im Wesentlichen möchte ich eine Datei drucken, die die Sequenz mit einem Abstand zwischen jedem Codon enthält. Die Eingabedatei enthält Tausende von offenen Leserahmensequenzen (d. H. Keine UTR).

Answer 1

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def splitCode(DNA): 
    return ' '.join(DNA[i:i+3] for i in xrange(0,len(DNA),3))