rcpp

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Rcpp Funktion langsamer als Rf_eval

Ich habe an einem Paket gearbeitet, das Rcpp verwendet, um beliebigen R-Code über eine Gruppe von großen medizinischen Bilddateien anzuwenden. Ich habe festgestellt, dass meine Rcpp-Implementierung we

r rcpp 2016-06-15

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k-mer Zählen in R mit perfektem Hashing

Ich arbeitete in der DNA K-Mers-Zählung und ich bereite diese Formulierung vor, um das Zählen mit perfekter Hash-Tabelle zu lösen: link. I RCPP API (C++) verwendet, um den Code in R zu integrieren: #i

c++ r math bioinformatics rcpp 2016-06-26

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Wie kann ich Rcpp verknüpfen, wenn keine libRcpp.so-Datei vorhanden ist?

Beim Versuch, mein C++ - Programm zu kompilieren, verknüpfe ich meine R-Dateien, aber Rcpp hat keine libRcpp.so-Datei. Hier ist die R-Code (Ich habe die c weggelassen ++): #include <R.h> #include <Rc

c++ r linux rcpp rinside 2016-07-04

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Rcpp kompilieren Fehler: kann die Liste nicht in SEXP konvertieren

Wenn ich einige funktionierende Rcpp-Code anpassen, um es in eine Klasse zu setzen, funktioniert es nicht mehr. Hier ist die Arbeit, nicht-klassenbasierte Code: #include <Rcpp.h> using namespace Rcpp

r rcpp 2016-07-06

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R - C++ - Code-Reproduktion in Rcpp Math.Min Problem

Ich versuche, einen C++ Code zu reproduzieren, den ich here über die LevenshteinDistance gefunden habe. Genauer gesagt, ich versuche, das Teil Start von static int LevenshteinDistance(string s, string

rcpp levenshtein-distance 2016-07-08

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Ist (und wann) RNGScope-Bereich in Rcpp-Code erforderlich?

Wann wird RNGScope scope benötigt, wenn Rcpp verwendet wird? In der Regel haben Sie need it bei Verwendung von C RNG-Funktionen. An einigen Stellen können Sie lesen, dass es not needed ist, wenn Sie R

r rcpp 2016-07-14

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R Eigenlöser ist schneller als Eigen?

Ich versuchte, den Eigen-Solver der Eigen-Bibliothek in R mit Leistung zu verbessern: // [[Rcpp::export]] MatrixXd Eigen4(const Map<MatrixXd> bM) { SelfAdjointEigenSolver<MatrixXd> es(bM);

r rcpp eigen eigenvector 2016-07-18

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Vermeiden Sie SIGSEGV beim Subsetting von data.frame mit Aufruf von `[data.frame` in Rcpp

Mein Rcpp-Code schlägt gelegentlich aus (SEGFAULT, etc.) aus Gründen, die ich nicht verstehe. Der Code erstellt einen großen data.frame und versucht dann, eine Teilmenge dieses data.frames durch Aufru

r rcpp rcpp11 2016-07-19

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Compiler für Quellpakete in Microsoft R öffnen

ich nur bin derzeit laufenden MRO Rgui auf Windows 10 (nicht mit RStudio oder RTVS) ich die MRAN Versionen von RCPP, RcppEigen & Matrix Pakete installiert haben. Wenn ich jedoch die neueste Version me

r windows gcc visual-c++ rcpp 2016-06-04

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Füllen Sie einen Teil eines Vektors mit zufällig ermittelten Werten in RCPP

Ich versuche, eine Sequential Monte Carlo Funktion in RCPP zu schreiben, und ich mit folgendem Problem: Ich habe einen Vektor, den die folgende Art und Weise erstellt: NumericVector R_t(Part*Ttau);

c++ r rcpp 2016-06-20

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