bioconductor

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Verwenden Sie 'require' Paketcode, um Datenpakete in R

on-the-fly zu erhalten. Ich schreibe ein R-Paket, das eine Vielzahl von Bioconductor Annotation-Datenpaketen verwendet. Die spezifischen Datenpakete variieren mit dem Anwendungsfall. Als solche habe i

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Bioconductor vs CRAN

Heute habe ich entdeckt, dass es außer CPAN ein anderes Repository gibt. Dieses Repository ist Bioconductor. Bisher habe ich festgestellt, dass der Prozess installation von Bioconductor etwas anders i

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R BiocCheck: Vielleicht sind sie Teil eines Datensatzes geladen mit Daten()?

bekam ich die folgende Meldung von BiocCheck (für Bioconductor): Checking to see if we understand object initialization.... * CONSIDER: Clarifying how objects ‘predict, qnorm, predict, lm, coef,

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Annotation DB hat keine 'wählen' Methode in rpy2

Ich habe den folgenden Code in R: require(hgu133a.db) entrezIDs <- select(hgu133a.db, probeNames, "ENTREZID") wo probeNames ist eine Liste von Strings an Sonden in dieser Datenbank enthalten entsp

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kein Verfahren zur Nötigung dieser S4 Klasse auf einen Vektor für die Nutzung von mclust

Ich versuche, die mclust Methode auf eine .FCS Format-Datei zu verwenden (die ein Durchflusszytometrie-Format-Datei ist) und wir lesen Sie diese Datei in R als flowFrame-Objekt. install.packages("open

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Wie zu vermeiden, Drucken/Anzeigen von Nachrichten

Diese Frage wurde zuvor gestellt, aber keine der Antworten funktioniert für mich. Ich verwende die Bibliothek rhdf5 von bioconductor.org, um HDF5-Dateien zu lesen: source ("http://bioconductor.org/bio

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Grad der Überzeugung nach dem Beweis-Code, der die Go-Annotation

unterstützen Ich möchte ein gewisses Maß an Glauben, dass wie die Go annotation zu einem bestimmten Begriff unterstützt wird, die durch Beweis-Code dargestellt wird zugeordnet werden. Es gibt verschie

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Beliebige "Liste" zu S4 "Liste" erzwingen?

Gibt es eine Möglichkeit, ein einfaches listenähnliches Objekt zu S4 "List" -Objekten zu zwingen? Ich muss meine Daten vektorisieren. Anscheinend habe ich Nested-Lapply für meine Funktionen verwendet,

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glEnd Fehler (Mesa-libGL/GLU) Installation "rgl" -Paket auf Centos6.7

Ich versuche, "rgl" auf CentOS 6.7 zu installieren, aber ich kann es nicht funktioniert. Sah zahlreiche ähnliche Probleme, aber keine Lösung funktionierte für mich. Mein System: Centos 6.7 R Version 3

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Warum kann ich nicht mehrere Plots mit einer for-Schleife sehen?

Dies ist mein Code, der Teil eines größeren Skripts ist. for(d1 in names(survD)){ survfit1 <- survfit(Surv(time=survD[[d1]][,"time"], event=survD[[d1]][,"death"],type='right')~1) png(p