genetics

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Wie plotten Positionen entlang einer Chromosom-Grafik

Ich möchte ein Diagramm erstellen, das 14 lineare Chromosomen für den Organismus, an dem ich arbeite, skaliert, mit farbigen Balken an bestimmten Stellen entlang jedes Chromosoms. Im Idealfall möchte

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Gentechnik-Simulation

Hat jemand eine gute Quelle für Software/Tutorial über Gentechnik-Simulation? Vielleicht Open-Source-Software über Gen-Splicing/Klon-Simulation? Dank

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Wie Sie den Inhalt einer Liste von Objekten als Bedingung für eine Schleife verwenden, um einen Datenrahmen in Python zu ändern

Hier ist meine Frage. Ich habe eine "Liste" von Objekten und einen Datenrahmen als Köpfe unten: 0 0 hsa-let-7f-2-3p 1 hsa-let-7f-2-5p 2 hsa-miR-105-3p 3 hsa-miR-105-5p 6 hsa-miR-106a-3p Und

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finden und Löschen von Zeilen, die mehr als 5% fehlende Daten haben

ich eine Matrix habe (so genannte Ergebnisse), die wie diese bisher id1 id2 id3 id4 id5 id6 id7 id8 id9 snp1 1 2 0 NA 1 1 1 2 1 snp2 2 2 2 2 0 2 NA NA 0 snp3 NA NA 1 NA 0 NA NA 2 2 aussieht, hab

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Wie ändern Sie die SNP-Werte?

My-Datensatz hat 3 SNPs, die wie unter Id SNP1 SNP 2 SNP3 1 AA AA AA 2 AG AC AG 3 GG CC GG 4 5 6 So on In SNP1 sieht - Ich mag würde die Werte AA = 2, AG = 1, GG = 0 und Ebenso in SNP1 und SN

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Karte SNP IDs zu Genom-Koordinaten

Ich habe mehrere SNP IDs (d. H., Rs16828074, rs17232800, etc ...), Ich möchte ihre Koordinaten in einem Hg19-Genom von UCSC genome website. Ich würde lieber R verwenden, um dieses Ziel zu erreichen. W