pbs

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TORQUE: Wie die Verwendung von Jobs Array-Einreichung für alle Benutzer zu verbieten: qsub -t?

Auf meinem Torque-Server-Manager möchte ich die Verwendung von Jobs Array-Übermittlung für alle Benutzer zu unterbinden: qsub -t. In der offiziellen Doc habe ich Pbs-Parameter gefunden, die dies verwa

cluster-computing pbs qsub torque 2016-07-04

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QSub Array Job Verzögerung

#!/bin/bash #PBS -S /bin/bash #PBS -N garunsmodel #PBS -l mem=2g #PBS -l walltime=1:00:00 #PBS -t 1-2 #PBS -e error/error.txt #PBS -o error/output.txt #PBS -A improveherds_my #PBS -m ae set

linux bash hpc pbs qsub 2016-07-05

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qsub außer Acht gelassen Speichergrenze

Mein Befehl lautet: qsub -t 1:30:1 -q test.q -l r_core=5 -l r_mem=30 run.sh Es startet 30 Instanzen, die jeweils auf einem Server, aber sie neigen dazu, mehr als der angegebenen 30 GB RAM zu verbrau

memory pbs qsub 2016-07-20

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Torque BankFailure (kann Jobkonto nicht belasten)

Ich bin neu mit Torque Scheduler und ich versuche, checkjob Befehl Ergebnis zu verstehen: BankFailure (cannot debit job account). Es handelt sich um ein Job „Q“ gekennzeichnet und erscheinen stecken W

pbs torque 2016-06-06

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Wie kann ich sehen, wo in der Warteschlange ich für einen Job in einem Cluster bin?

Ich verwende einen Cluster-Computer, um einen "lmem" Job zu berechnen. Ich habe meinen Job vor einem Tag eingereicht, und obwohl der Job normalerweise sofort ausgeführt wird und ich überwachen kann, w

queue cluster-computing pbs qsub 2016-06-06

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Befehl zum Ausführen des Jobs ausschließlich auf einer einzelnen Instanz im cfncluster-SGE-Scheduler

Ich möchte einen Auftrag exklusiv an einen einzelnen Knoten in cfncluster mit SGE-Scheduler Qsub-Option übergeben. Kennt jemand die korrekte Möglichkeit, die vollständige Instanz für einen Job im cfnc

cluster-computing pbs qsub sungridengine 2016-07-27

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warten auf bereits abgeschlossene Jobs

Ich starte ein PBS-Skript, sobald andere abgeschlossen sind. Dazu benutze ich folgende Befehle: $ job1=$(qsub job1.pbs) $ jobN=$(qsub jobN.pbs) $ qsub -W depend=afterok:$job1:$jobN join.pbs Dies f

cluster-computing hpc pbs qsub torque 2016-07-28

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Wie PBS Skript ketten?

Ich versuche, dieses Bit PBS-Code auszuführen, wo ich Teil 2 nach Abschluss von Teil1 ausführen möchte, aber aus irgendeinem Grund führt Teil2 nach Abschluss Teil1 nicht ausführen. Wie kann ich das Te

bash sh bioinformatics hpc pbs 2016-07-29

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entfernen verlassen Auftrag aus qstat Liste

Ich bin auf einem PBS-Server arbeiten und wenn ich schreibe qstat -u Benutzername -t Ich erhalte die folgende Ausgabe: Req'd Req'd Elap Job ID Username Queue Jobname SessID NDS

jobs global-asax pbs torque 2016-06-12

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Redirect Ausgabe meines Java-Programms unter qsub

Ich bin derzeit mehrere ausführbare Java-Programm mit qsub ausgeführt. Ich schrieb zwei Skripte: 1) qsub.sh, 2) qsub.sh #! /bin/bash echo cd `pwd` \; "[email protected]" | qsub run.sh #! /bin/bash

pbs qsub sungridengine queueing 2016-08-08

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