sequence-alignment

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Traceback im Smith-Wateman-Algorithmus mit affiner Gap-Strafe

Ich versuche, den Smith-Waterman-Algorithmus für die lokale Sequenzausrichtung mit der affinen Gap Penalty-Funktion zu implementieren. Ich denke, ich verstehe, wie man die Matrizen einleitet und berec

python bioinformatics biopython sequence-alignment 2013-08-07

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Mehrfache Sequenzausrichtung (Längste gemeinsame Subsequenz)? diese

OK ist, was ich tun möchte: Mehr als zwei Strings und „align“ sie (keine DNA/RNA-Sequenz oder dergleichen, ganz normale Saiten nicht wie 1000 Elemente in jeder von ihnen) Ich habe bereits einige Arbei

python objective-c perl lcs sequence-alignment 2012-04-09

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Print Sequenzabgleich Datei

ich einen einfachen paarweise DNA-Sequenzabgleich mit pairwiseAlignment vom Biostrings Paket in Bioconductor: library('Biostrings') seq1 = 'ATGCTA' seq2 = 'ATGTA' pairwiseAlignment(pattern = seq1,

r alignment sequence bioconductor sequence-alignment 2012-04-13

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R EnvironmentError: Ghostscript konnte im Pfad nicht gefunden werden. RWebLogo

Ich stieß auf eine seltsame Frage, die ich in keiner Weise beheben kann und ich hoffte, dass jemand hier ein besseres Verständnis davon hat, was falsch ist; Ich kann RWebLogo-Paket nicht verwenden - s

r bash ghostscript sequence-alignment user-environment 2015-01-16

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